Stability of the Courses of the Warm Coastal Currents along the Kyushu Island Suggested by the Population Structure of the Japanese Turban Shell, Turbo (Batillus) Cornutus     

Shigeaki Kojima  Ryoko Segawa  Ikuo Hayashi 《Journal of Oceanography》2000,56(5):601-604

The genetic structure of a population of the Japanese turban shell, Turbo (Batillus) cornutus at Sata-Misaki Point, on the southern coast of Kyushu Island, was determined on the basis of nucleotide sequences of mitochondrial DNA and compared with that of a population of the western coast of Kyushu Island. The significant genetic differentiation between these two populations suggests that the courses of the warm currents along the coast of the Kyushu Island have been relatively stable after the divergence between the two genetically distant groups of the Japanese turban shell, which was estimated to have occurred during some period in Pleistocene.  相似文献   

日本绒螯蟹放流群体12S rRNA序列研究   总被引：1，自引：0，他引：1  

高天翔  王溪宏 《海洋湖沼通报》2000,(1):47-51

参考果蝇与蚤状汊序列进行了日本绒螯蟹放流群体的线粒体ＤＮＡ１２Ｓ ｒＲＮＡ基因片段的引物设计、ＰＣＲ扩增及序列测定,得到４５７ｂｐ的碱基序列,其Ａ、Ｔ、Ｇ、Ｃ含量分别为１５８ｂｐ（３４．５７％）、１７８ｂｐ（３８．９５％）、５１ｂｐ（１１．１６％）、７０ｂｐ（１５．３２％）,与果蝇与蚤状相同基因片段序列含量相似。  相似文献   

日本绒螯蟹线粒体DNA序列研究I.12S rRNA   总被引：5，自引：0，他引：5  

高天翔  张秀梅  吉崎悟朗  渡边精一 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2000,30(1):43-47

参考果蝇与蚤状  相似文献   

日本绒螯蟹线粒体DNA序列研究Ⅱ.16S rRNA   总被引：2，自引：2，他引：0  

高天翔  任一平  张秀梅  渡边精一  杨永恒 《中国海洋大学学报(自然科学版)》2000,30(3):482-486

参考果蝇、卤虫与锯缘青蟹的线粒体 DNA16 S r RNA基因序列进行了日本绒螯蟹相同基因片段的引物设计、PCR扩增及序列测定 ,得到 56 7bp的碱基序列 ,其 A、T、G、C含量分别为194 bp(34.2 2 % )、2 16 bp(38.10 % )、98bp(17.2 8% )、59bp(10 .4 1% ) ,与果蝇、卤虫及锯缘青蟹类的 16 S r RNA基因片段序列含量相似。  相似文献   

高体(鱼狮)(Seriola dumerili)线粒体全基因组测定及结构特征分析          下载免费PDF全文

王开杰  徐永江  崔爱君  柳学周  姜燕  王滨 《海洋与湖沼》2022,53(1):120-132

为快速有效鉴别(鱼师)属鱼类物种、加强(鱼师)鱼遗传多样性管理与种质资源保护,通过Illumina测序技术,获得了东海海域养殖高体(鱼师)(Seriola dumerili)线粒体基因组全序列(16 530bp),碱基组成为A (26.83%)、G (17.6%)、C (30.04%)和T (25.53%), A+T含量为52.36%,且非编码控制区(D-loop)A+T富含61.64%,表现明显的AT偏好性。与其他硬骨鱼一样,高体(鱼师)线粒体基因组包含13条蛋白编码基因, 22个tRNA基因, 2个rRNA基因,除ND6、tRNA^Gln、tRNA^Ala、tRNA^Asn、tRNA^Cys、tRNA^Tyr、tRNA^Ser、tRNA^Glu、tRNA^Pro基因外,其余均位于H链编码;蛋白编码基因中,除COⅠ、COⅡ和ND5的起始密码子分别为ATC、ATA和ATA外,其余10个蛋白编码基因的起始密码子均为ATG,以典型的TAA和TAG为终止密码子,在ND4和Cytb中存在不完全密码子T;除tRNA^Ser-GCT外,其余21个tRNA均为典型三叶草二级结构。比较中国和日本海域高体(鱼师)线粒体基因组发现, CO Ⅰ、CO Ⅱ和ND5蛋白编码基因在起止位置、片段长度及起止密码子上存在显著差异。此外,与同属的黄条(Seriola aureovittata)和五条(鱼师)(Seriola quinqueradiata)的线粒体基因组13个蛋白编码基因进行两两对比分析,结果表明3种(鱼师)属鱼类的蛋白编码基因的相似性在85%~100%之间。基于线粒体基因组全序列构建的系统发育树,成功将高体(鱼师)与其他(鱼师)属鱼类有效区分,高体(鱼师)与长鳍(鱼师)同属一支,亲缘关系最近;黄条(鱼师)和五条(鱼师)聚为一支,亲缘关系最近。  相似文献   

新疆一种琥珀螺线粒体基因组测序分析     

马蕊  阿尔祖古丽&#;买买提吐尔逊  张卫红 《海洋科学》2022,46(10):159-166

本研究利用高通量测序技术获得采自新疆昭苏琥珀螺科一未知种的线粒体全基因组序列。该种琥珀螺线粒体基因组全长14219bp,由13个蛋白质编码基因,22个tRNA基因,2个rRNA基因及1个控制区组成。基因组中AT含量为76.43%,GC含量为23.57%,表现出明显的AT偏好性。13个PCGs多使用ATG为起始密码子,TAA为终止密码子。tRNA基因中tRNA-Ser1和tRNA-Ser2缺少DHU臂,其中tRNA-Ser1在缺失的DHU臂处有一个小的茎环结构。非编码区位于COX3与tRNA-Ile之间,长度为58bp。琥珀螺科中现有腐败琥珀螺Succineaputris、五家渠尖缘螺Oxylomawujiaquensis和Omalonyxunguis的线粒体基因组被报道。三者的基因排列顺序和结构基本相似。昭苏琥珀螺未知种的基因排列顺序与它们有所不同。昭苏琥珀螺未知种的tRNA-Tyr和tRNA-Trp基因位于COX2和tRNA-Gly之间,上述三种tRNA-Tyr和tRNA-Trp基因位于tRNA-Ser2和tRNA-Ser1之间。系统发育树结果显示,琥珀螺科的四种聚为一支,为单系群,其中腐败琥珀螺和Omalonyxunguis亲缘关系更近。本研究结果支持昭苏琥珀螺未知种为中国一未报道的属种,但要确定其是否为一新属新种尚需更多的分子和形态数据。  相似文献   

Nassarius corniculus (Olivi, 1792) (Caenogastropoda: Nassariidae): a model of environmental complexity of Italian brackish and marine habitats     

Maria Alessandra Iannotta  Francesco Toscano  & Francesco Paolo Patti 《Marine Ecology》2009,30(1):106-115

Strong environmental selection may give rise to complex species and/or camouflage the presence of sibling species in brackish waters. The prosobranch gastropod Nassarius corniculus (Olivi, 1792) is a common scavenger widely distributed in Mediterranean brackish and marine areas. We examined the morphological and molecular features of N. corniculus populations and related these features to the environmental complexity of brackish habitats. Morphological data revealed differences in radular features between specimens collected from two Mediterranean lagoons (Lake Faro, Messina, Sicily and Lake Fusaro, Gulf of Gaeta). Analysis of with the mitochondrial marker mt 16S rRNA revealed genetic variability within the Lake Faro population but did not show the different geographic structure between the two lagoons indicated by morphological data. We also predicted the gene flow of N. corniculus by comparing populations of two marine areas (Faro Sea and Ischia).  相似文献   

一个新的ENSO监测指标的研究   总被引：10，自引：0，他引：10       下载免费PDF全文

郭艳君  翟盘茂 《应用气象学报》1998,9(2):169-177

利用1982～1996年逐月平均SST和OLR资料,首先通过奇异值分解（SVD）技术研究了热带太平洋大气对流活动和海温场的时间和空间结构及其相互关系。结果表明,第一模态都明显地反映出ENSO信息,两场间具有很高的相关。分析了80年代以来的E1 Ni?o/La Ni?a盛期的热带太平洋对流活动场以及NINO 3指数与OLR场的点相关,结果指出,中东太平洋和西太平洋上存在类似偶极子型的两个符号相反的相关区,与SVD第一模态空间分布型十分相似。由此建立了反映ENSO期间热带中东太平洋和西太平洋反向变化的对流涛动  相似文献   

钦州湾牡蛎线粒体16S rRNA和COⅠ基因片段的序列变异分析     

李咏梅  陈秀荔  赵永贞  陈晓汉 《广东海洋大学学报》2009,29(3)

利用线粒体16S rRNA基因和线粒体细胞色素氧化酶亚基Ⅰ(cytochrome oxidaseⅠ,COⅠ)基因片段初步研究钦州湾牡蛎(Ostrea)的物种组成。以特异引物进行PCR扩增,对扩增产物进行纯化、测序,分析表明,16S rRNA基因部分长度为413bp,COⅠ基因部分长度为535bp,2种牡蛎序列的碱基组成均显示出较高的A+T比例:16S rRNA基因59.8%;COⅠ基因60.5%。对位排序比较表明,16S rRNA片段种内个体间变异较小,存在7个变异位点,4种单倍型,其中包括5个转换位点突变,2个颠换位点突变;COⅠ片段有30个碱基存在变异,7种单倍型,其中包括16个转换位点突变,14个颠换位点突变。运用MEGA4软件计算出不同个体间的遗传距离,并构建了NJ和UPGMA系统树。香港牡蛎(Crassostrea hongkongensis)16S rRNA和COⅠ序列与白肉牡蛎的遗传距离均为0.000,有明巨牡蛎(Crassostrea ariakensis)16S rRNA和COⅠ序列和红肉牡蛎(red meat ostrea)的遗传距离分别为0.000和0.011,白肉牡蛎16S rRNA和COⅠ序列和红肉牡蛎之间的遗传距离分别为0.035和0.146。结果表明,钦州湾牡蛎分为2个不同的种,线粒体16S rRNA和COⅠ基因在种间存在明显的多态性,证实了16S rRNA和COⅠ基因序列适用于牡蛎的系统学分析。  相似文献   

鲸类线粒体基因组特征分析及分子标记探讨     

田美  申欣  孟学平  程汉良 《海洋学报》2011,33(5):104-114

综合分析鲸类32个物种的线粒体基因组全序列,全面揭示了鲸类线粒体基因组的基本特征、蛋白质编码基因、选择压力和差异位点等.鲸类线粒体基因组均编码后生动物标准的37个基因.绝大多数鲸类线粒体基因组的基因排列顺序完全相同,而且与脊椎动物线粒体基因组的典型排列一致.4个类群(真露脊鲸属、须鲸属、原海豚属和宽吻海豚属)线粒体基因...  相似文献